《航海王OL》采用的是手动释放技能+自动回合的战斗模式。玩家可以在一个九宫格内包排布括主角在内可上场5位角色上场，每个角色都有4种技能，包括必杀技（角色最强招式，分位瞬发和非瞬发两种），普攻，追打（在战斗中通过伙伴之间不同的攻击方式来进行追打。通过不同的伙伴的组合，达成更高的Combo数，造成更高的伤害），被动（被动就是每个角色自带），如何组合搭配出最佳的阵容就是游戏的策略点。

《航海王OL》在战斗可手动决定必杀技释放的目标以及时机。释放必杀技的时机以及选择的目标，可打断敌方的必杀技，Combo链，击败敌方重要伙伴。所以必杀技的释放，也是一个策略性的决策。

《航海王OL》部分角色在释放必杀技的时候，会有特写，必杀技有着华丽的特效，比如结界奥义被释放后,场景也会随之变化，全员在结界中进行战斗，所有人都会受到结界效果的影响。拥有变身奥义的伙伴施放了奥义后会进入变身状态，改变原有角色的特性与技能。

《航海王OL》中主角是要养的，吃吃经验，穿穿装备，还要选择合适的天赋。

如何搭配好所有小伙伴的奥义，普攻，追打和被动，是这个游戏的乐趣所在